Перейти к публикации
17 сентября в Нижнем Новгороде открылась XV Всероссийская генеалогическая выставка.
Подробнее...


Генеалогия и генетика


 Поделиться

Рекомендованные сообщения

Сейчас легко проверить "семейную легенду" о том, что среди предков оказался А.С.Пушкин.

В ФТДНА в открытом доступе находится, минимум, три его документальных потомка. Родство с которыми будет где-то на уровне пятиюродного. Все эти три человека (включая князя и графа) являются "референтными персонами", по моей терминологии. "Чистые" дворяне, без вкраплений предков иных сословий.

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

Про общих предков.

Смотрим функцию In Common With.

Она покажет тех людей, которые пересекаются как с вами, так и с анализируемой персоной.

Т.е. существуют определенные шансы, что вся троица связана общим предком.

Изменено пользователем Mich Glitch
Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

Михаил, прочитал Ваши посты, но мы с Вами говорили о разных вещах. Эти инструменты мне известны, а я другие инструменты имел ввиду, как мог разъяснил их выше.

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

2 минуты назад, Mich Glitch сказал:

Про общих предков.

Смотрим функцию In Common With.

Она покажет тех людей, которые пересекаются как с вами, так и с анализируемой персоной.

Т.е. существуют определенные шансы, что вся троица связана общим предком.

Да, именно этот механизм я и подразумевал.

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

Михаил, как бы Вы прокомментировали мои "картинки"?

Что например, означает совпадение с моим братом двух коротких сегментов во 2-й хромосоме и один большой сегмент с неким Стенли Зелинским?

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

1 час назад, Бибиков Валерий сказал:

Михаил, как бы Вы прокомментировали мои "картинки"?

Что например, означает совпадение с моим братом двух коротких сегментов во 2-й хромосоме и один большой сегмент с неким Стенли Зелинским?

И все же. В Вашем вопросе кроется ответ.

Вы имеете сегменты с братом и с неким дальним родичем.

Хотя наверняка Степень Родства верно указывает Вашу и брата родственную связь. А дальнего родственника указывает как дальнего родственника.

Рассматривание сегментов имеет практический смысл, ктгда протестирован кто-то из родителей, а мы хотим знать, с чьей стороны (отца, или мамы( идет родственная связь.

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

Михаил, а на мои вопросы Вы не ответили... я ведь спрашивал о количестве сегментов в одной хромосоме и их величине.

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

Валерий, вопрос расплывчат. Вот и ответ никакой.

 

Мы имеем участки половинного совпадения у персоны А и Б. Хорошо.

В то же время, на том же самой месте той же самой хромосомы у персон А и В тоже есть половинные совпадения?

И?

Какие далеко идущие выводы мы можем сделать на основании этих предпосылок?

 

Правильно! Почти никакие.

 

Первое. Половинное совпадение не означает тождества. Иными словами, нет оснований полагать, что данный участок у А, Б и В совершенно идентичный. Говоря генеалогически, выводящий на общего предка.

Второе. Речь может идти о т.н. "реликтовых гаплоблоках". Термин расплывчат и неточен. Но в данном случае говорю об идентичных участках генома, присущих всем членам большой популяции.

Третье. Можем иметь т.н. "ложные УПСы". То есть такие случаи, когда свопадающий участок состоит из частей, унаследованных, как от отца, так и от матери.

 

Основной вывод (который идёт рефреном во всех моих последних сообщениях): не заморачивайтесь Вы рассмотрением участков. Используйте уже готовые выводы о предполагаемой степени родства.

(Аналогия. Для того, чтобы хорошо ездить на автомобиле, совершенно не обязательно знать принцип работы четырёхтактного двигателя внутреннего сгорания.)

Изменено пользователем Mich Glitch
Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

04.03.2022 в 16:15, Бибиков Валерий сказал:

Михаил, как бы Вы прокомментировали мои "картинки"?

Что например, означает совпадение с моим братом двух коротких сегментов во 2-й хромосоме и один большой сегмент с неким Стенли Зелинским?

Ничего.

Говоря иначе, ни Вы, ни я, ни кто-то другой не сделает исходя из этой информации точного и неоспоримого вывода. Можем лишь наплодить гипотез разной степени достоверности.

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

И опять повторю своё мнение о том, когда рассмотрение сегментов имеет смысл.

При определении, с какой родительской стороны идёт родство.

Допустим, у меня есть родич, с которым имею УПС на 13 хромосоме:

Clipboard02.jpg

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

Я протестировал свою маму. И вижу, что у неё на том же участке 13 хромосомы есть УПС с данным человеком. Отсюда можно заключить (с оговорками!), что родство у меня с родичем идёт с маминой стороны.

Clipboard01.jpg

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

Данный пример ещё хорош для понимания т.н. "поколенного затухания". Или того утверждения, что тестировать в первую очередь нужно представителей старших поколений.

У моей мамы с протестированным четыре УПСа. А у меня - всего лишь один.

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

Вернусь к Вашему вопросу про брата. У меня есть пара брат/сестра и тройка брат/две сестры.

То, что у брата с кем-то УПС на каком-то участке какой-то хромосомы - вовсе не означает, что у его сестры имеется УПС в том же самом месте.

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

Вот пример к моему утверждению из последнего поста.

Моя сестра и всё тот же родич.

У сестры УПС на 10 хромосоме. (Со стороны нашей мамы.)

А у меня - на 13-й.

Clipboard01.jpg

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

Михаил, все Ваши посты сводятся к одному выводу - аутосомы наследуются случайным образом, так это известно. Речь шла о тех случаях, когда они точно проявились у совпаденцев, что на мой взгляд уже является доказательством родства, а совпадение сегментов у нескольких человек по одной хромосоме, да еще и одинакового размера... Ну да ладно.

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

42 минуты назад, Бибиков Валерий сказал:

Михаил, все Ваши посты сводятся к одному выводу - аутосомы наследуются случайным образом, так это известно. 

Нет, не так.

 

Все мои сообщения сводятся к тому, что рассмотрение участков, в большинстве случаев, совершенно бессмысленная трата времени.

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

Я привёл примеры по брату и сестре. Когда УПСы с одним и тем же родственником расположены на разных хромосомах.

Могу привести по тройке брат-сестра-сестра. Но зачем? Вы всё равно продолжаете спрашивать про участок, совпадающий у двух братьев и "чужого дяди".

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

Теперь про половинные совпадения.

 

Допустим у одного человека имеется цепочка нуклеотидов (для простоты, всего в две позиции) AG и CT.

А его родич имеет AA и CC.

Они, эти два протестированных, стало быть, имеют УПС (участок половинного совпадения) длинною в два снипа со значениями А и С.

 

А если у третьего товарища, скажем, по тем же позициям GG  и ТТ, то и он имеет с первым протестированным УПС. Но на сей раз со значениями G  и Т.

 

*** Это я пояснил второй свой тезисок о том, что наличие УПСа у разных людей на одном и тоем же участке одной и той же хромосомы - совершенно не обязательно означает восхождение к общему предку.

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

Я ожидал серьёзного возражения. Типа, Вы мне попеняете на то, что я призываю к "опрощению". К "абстрагированию". К "принципу чёрного ящика" (когда не интересует внутренняя кухня, а только исходные данные и конечный результат).

А сам при этом, вместо того, чтобы воспользоваться функцией In Common With для протестированного и кого-то из его родителей, - занимаюсь разглядыванием УПСов в хромосомном браузере.

Тут резон прост. Протестированный родитель может быть связан с матчем через одного предка. А его ребёнок - через другого. Т.е. по своему другому, непротестированному, родителю.

Поэтому и смотрим участки.

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

Ну, и составные (ака "ложные" УПСы). Как без них?   :)

По моим выкладкам, составные УПСы составляют до 25% от всех имеющихся.

Пример. У моей дочери имеется около 25% участков половинного совпадения, которые отсутствуют и у меня (её отца) и у моей жены (матери нашей дочери).

 

 

*** Практический вывод от этого утверждения заключается в том, что современные алгоритмы плохо отрабатывают множественные родственные пересечения. Или, говоря иначе, не менее 25% Ваших матчей показывают родичей много ближе, чем есть на самом деле.

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

Посмотрел вчера популярный фильм про китайский генетический центр. Собак они клонируют только так. Цель они объявили -создание коллекции генотипов всех живых существ на Земле. И Билл Гейтс там отметился

Вот поискала в интернете

https://www.bbc.com/russian/vert-fut-37165516

 также

https://www.bbc.com/russian/features-45738848

Фрэнсис Арнольд придумала, как имитировать этот процесс и фактически направлять эволюцию. Она разработала технологию, которая позволяет вносить изменения в ДНК, где закодирована информация для производства "биологических стройматериалов" организма.

В результате клетка начинает производить новые, ранее не существовавшие ферменты (энзимы) - то есть белки, которые ускоряют химические реакции и могут быть использованы в самых разных целях.

А Смит и Винтер научились использовать оболочку питающихся бактериями вирусов (бактериофагов) для отображения новых белков.

Закодированные учеными протеины выводятся туда, как на экран, именно поэтому их метод получил название "фаговый дисплей".

 

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

https://iz.ru/960139/ignat-shestakov/tiurma-vmesto-nobelevki-uchenyi-spasavshii-detei-ot-vich-lomal-im-geny

Перед этим ученый говорил, что выбрал Китай для эксперимента именно потому, что в стране не действовал запрет на редактирование генома эмбрионов. Видимо, он проверил не все законы. 30 декабря 2019 года Суд города Шэньчжэнь на юге Китая приговорил ученого Хэ Цзянькуя (He Jiankui) к трем годам тюрьмы и штрафу в 3 млн юаней (около $430 тыс.). Он осужден за модификацию генома эмбрионов человека.

Что сделал ученый
Задачей ученого было «отключить» ген CCR5. Он связан с формированием белка, позволяющего вирусу попасть в клетку. Хэ работал с парами, в которых ВИЧ-положительными были мужчины. Они принимали препараты и потому были незаразны. Геном был изменен в 16 эмбрионах, из них 11 были использованы для искусственного оплодотворения. Одна женщина в результате забеременела. Как говорил Хэ, обе копии гена CCR5 удалось изменить лишь у одной из близняшек. У второй отредактирована одна копия, так что она может в будущем заразиться ВИЧ. Позже Хэ говорил, что еще одна женщина ждет ребенка с отредактированным геномом. Женщина эта родила, но никакой информации о ее ребенке найти не удалось. Близняшек власти Китая тоже теперь скрывают.

 

 

Когда Хэ рассказал об исследованиях на Втором международном саммите по генетическому редактированию человека в Гонконге, большинство коллег отнеслось к ним негативно. Нобелевский лауреат Дэвид Балтимор (David Baltimore) напомнил, что отключение гена CCR5 повышает опасность заражения лихорадкой Западного Нила и другими вирусными заболеваниями, а также увеличивает вероятность смерти от гриппа. Неприемлемым назвала эксперимент и Дженнифер Дудна (Jennifer Doudna), одна из создательниц технологии редактирования генома CRISPR/Cas9, которую использовал Хе.

 

В феврале этого года Минобрнауки вместе с РАН разработали проект программы развития генетических технологий на 2019–2027 годы. Сделать это распорядился в ноябре 2018 года президент Владимир Путин. Тогда отмечалось, что программа нужна для ускорения развития генетических технологий и предупреждения чрезвычайных ситуаций биологического характера.

Изменено пользователем Valentina
Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

http://russian.news.cn/2019-10/29/c_138512956.htm

На юге Китая создали Центр геномной инженерии и терапии
2019-10-29 20:45:56丨Russian.News.Cn
Пекин, 29 октября /Синьхуа/ -- В Шэньчжэне, городе в провинции Гуандун на юге Китая, на днях создали Научно-исследовательский центр геномной инженерии и терапии. Об этом пишет газета "Чжунго кэсюэ бао" /"Наука Китая"/, издаваемая Академией наук Китая /АНК/.

Новая организация будет вести исследования в области редактирования генома, генной и клеточной терапии, а также синтетической биологии в соответствии с международными практиками.

Центр поставил перед собой задачу освоить передовые генные технологии для борьбы с основными заболеваниями, развивать прицельную медицину на основе машинного обучения и искусственного интеллекта, отметили в Шэньчжэньском институте передовых исследований АНК.

В центр приглашен американский генетик, профессор Гарвардского университета Джордж Черч.

Ссылка на комментарий
Поделиться на других сайтах

Присоединяйтесь к обсуждению

Вы можете опубликовать сообщение сейчас, а зарегистрироваться позже. Если у вас есть аккаунт, войдите в него для написания от своего имени.

Гость
Ответить в теме...

×   Вставлено в виде отформатированного текста.   Вставить в виде обычного текста

  Разрешено не более 75 эмодзи.

×   Ваша ссылка была автоматически встроена.   Отобразить как ссылку

×   Ваш предыдущий контент был восстановлен.   Очистить редактор

×   Вы не можете вставить изображения напрямую. Загрузите или вставьте изображения по ссылке.

 Поделиться

  • Сейчас на странице   0 пользователей

    • Нет пользователей, просматривающих эту страницу.
×
×
  • Создать...

Важная информация

Пожалуйста, прочитайте Условия использования